Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hmgn5Q9JL35 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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