Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Ccl28Q9JIL2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms