Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rb1cc1Q9ESK9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rb1cc1Q9ESK9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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