Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Gm14576-201ENSMUST00000118073 1111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13626-201ENSMUST00000119435 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm14257-201ENSMUST00000144649 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm26820-201ENSMUST00000180764 1008 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 n-R5s36-201ENSMUST00000082998 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Prkag2os2-201ENSMUST00000123610 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm15624-201ENSMUST00000145420 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm35665-201ENSMUST00000206742 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riok3Q9DBU3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms