Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Smg9Q9DB90 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Smg9Q9DB90 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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