Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ift43Q9DA69 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ift43Q9DA69 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ift43Q9DA69 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ift43Q9DA69 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms