Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Mrpl17Q9D8P4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms