Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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