Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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