Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc94Q9D6J3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc94Q9D6J3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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