Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PudpQ9D5U5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms