Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc7Q9D541 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc7Q9D541 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ccdc7Q9D541 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc7Q9D541 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc7Q9D541 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ccdc7Q9D541 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc7Q9D541 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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