Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Taf1dQ9D4V4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Taf1dQ9D4V4 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms