Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
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Fndc8Q9D2H8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Fndc8Q9D2H8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
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Fndc8Q9D2H8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Fndc8Q9D2H8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms