Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lmbr1lQ9D1E5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms