Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Mrpl28Q9D1B9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Mrpl28Q9D1B9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Mrpl28Q9D1B9 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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Mrpl28Q9D1B9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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