Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed3Q9D0L1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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