Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rfc5Q9D0F6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Rfc5Q9D0F6 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Rfc5Q9D0F6 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Rfc5Q9D0F6 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rfc5Q9D0F6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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