Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssbp3Q9D032 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssbp3Q9D032 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssbp3Q9D032 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssbp3Q9D032 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssbp3Q9D032 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssbp3Q9D032 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssbp3Q9D032 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms