Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrs1Q9CYH6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rrs1Q9CYH6 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms