Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
ChtopQ9CY57 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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