Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Snx7Q9CY18 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Snx7Q9CY18 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx7Q9CY18 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx7Q9CY18 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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