Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Q9CWU4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Q9CWU4 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms