Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cnot11Q9CWN7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cnot11Q9CWN7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms