Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
NubplQ9CWD8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms