Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Fcf1Q9CTH6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms