Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Rprd1bQ9CSU0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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