Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Smim8Q9CQQ0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms