Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Nicn1Q9CQM0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Nicn1Q9CQM0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms