Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms