Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Atp6v0e1Q9CQD8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Atp6v0e1Q9CQD8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Atp6v0e1Q9CQD8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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