Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med4Q9CQA5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Med4Q9CQA5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms