Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
StambpQ9CQ26 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms