Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Nsmce3Q9CPR8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Nsmce3Q9CPR8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms