Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Smim3Q99PE5 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms