Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms