Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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NsmfQ99NF2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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NsmfQ99NF2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NsmfQ99NF2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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