Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Vmp1Q99KU0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms