Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ddb2Q99J79 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ddb2Q99J79 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ddb2Q99J79 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ddb2Q99J79 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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