Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Apobec3Q99J72 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Apobec3Q99J72 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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