Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cldn16Q925N4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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