Protein–RNA interactions for Protein: Q923P0

Col20a1, Collagen alpha-1(XX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col20a1Q923P0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col20a1Q923P0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Col20a1Q923P0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col20a1Q923P0 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms