Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Csmd1Q923L3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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