Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Sh3bgrl3Q91VW3 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms