Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slc6a20aQ8VDB9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a20aQ8VDB9 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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