Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm4cQ8VCD7 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm4cQ8VCD7 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm4cQ8VCD7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm4cQ8VCD7 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Kdm4cQ8VCD7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Kdm4cQ8VCD7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kdm4cQ8VCD7 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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