Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Top1mtQ8R4U6 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Top1mtQ8R4U6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms