Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Atg10Q8R1P4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Atg10Q8R1P4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms