Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rnf183Q8QZS5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms