Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Hoxc12Q8K5B8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Hoxc12Q8K5B8 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Hoxc12Q8K5B8 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms